Неудачно закончилась и вторая попытка создания своего флота в ходе Русско-шведской войны 1656—1661 гг., которую Московское государство начало также за выход на Балтийское море. Согласно стратегическому плану, разработанному в Москве, русские войска с началом этой войны
развернули наступление на четырех направлениях. Главным из них было рижское, на котором наступал наиболее крупный отряд русских войск.
Наступление вдоль Западной Двины потребовало содействия войскам со стороны флота. Для этой цели на берегах реки было построено до 1400 барок и стругов, на которых перевозились войска, вооружение, боеприпасы и продоволь- А Л Ордин-Нащекин ствие. С занятием шведского города Кокенгаузен, расположенного на Западной Двине, в нем по предложению выдающегося государственного деятеля Московии А. Л. Ордин-Нащекина и под его руководством были созданы верфи, на которых началась постройка парус- но-гребных кораблей, предназначенных для содействия русским войскам
Но завершить развернувшееся строительство флотилии в Кокенгаузене А. Л. Ордин-Нащекину не удалось. В связи с начавшейся войной с Польшей, не желая вести войну на два фронта, московское правительство решило пойти на мир со Швецией. По заключенному 1 июля1661 г. между Москвой и Швецией Кардисскому миру русские войска обязывались оставить ряд городов и районов, занятых ими в ходе наступления. Среди них был и город Кокенгаузен. Оставляя этот город, русским пришлось уничтожить построенные в нем верфи, портовые сооружения и корабли, предназначенные для западно-двинской военной флотилии.