Боевые речные корабли и катера:
Мониторы "Активный", "Дальневосточный комсомолец", "Дзержинский", "Киров", "Красный Восток", "Ленин", "Свердлов", "Сунь-Ят-Сен".
Канонерские лодки "Бурят", "Красная Заря", "Красное Знамя", "Монгол", "Пролетарий", КЛ-31 - КЛ-37 (они же № 31 - 37).
Бронекатера БК-11 - 29, 31 - 38, 41 - 47, 51 - 56, 61 - 66, 71, 7375, 81, 84, 91-94, 139-152.
Минные катера МК-41 - 48. Сторожевые катера СКА-1 — 3. Минные заградители "Сильный", "Труд". Сетевой заградитель ЗБС-1. Тральщики РТЩ-2, 50 - 58, 64. Катера-тральщики РТЩ-3 - 33, 40 - 48.
Вспомогательные речные суда и плавучие средства:
Тральные катера-буксировщики трал-барж Б-1 - 11. Катера-дымзавесчики ДЗ-1 - 4.
Плавучие зенитные батареи ПЗБ № 586 - 588, 1230, 1231, 1233 (все -несамоходные), 1232, 1234 (самоходные). Штабное судно "Амур".
Плавучие базы ДПБ-1 (дегазационная, самоходная), "Молотов" (самоходная), ПБ-1 (или № 1, бронекатеров, самоходная), ПБ-2 (несамоходная), ПБ-3, ПБ-4 (бронекатеров, самоходная), ПБ-5, "Рефрежира-тор" (продовольственная, несамоходная), "Рефрежиратор № 44" (или Р-44, продовольственная, самоходная), "Сергей Лазо" (бронекатеров, самоходная), без обозначения (бывшая П-18, катеров-тральщиков, несамоходная)
Санитарные транспорты СТР-1 - 4, "Коминтерн", "Маяковский", "Чиче-рин".
Военные транспорты "Астрахань", "Грозный" "Магнитогорск", "Мурманск".
Спасательные суда "Кема", "Кузнецк"1, П-12, СС-12, "Севастополь", "Сунгари".
Водолазный спасательный катер ВСК-1.
Буксирные пароходы "Кузнецк", МС-38, МС-40, Х-1, "Харьков".
Рейдовые буксиры Х-31, Х-33.
Гидрографическое судно "Перекат".
Обстановочное судно "Ростов".
Гидрографические катера "Пеленг", "Планшет".
Лоцманские катера ПБ-201, СДР-82.
Полуглиссеры № 1-5, 41, 42, 201, 209.
Паровой катер ХК-8 (портовый).
Моторные катера "Бот", "Интернационал", ИУ-3 (буксирный), "Лимузин", МК, НКЛ-27, "Полубот", "Фин", ХК-1 (пассажирский), ХК-2 (буксирный), ХК-5 (пассажирский), ХК-11 (разъездной), ХК-14 (буксирный), ХК-20 (буксирный) ХК-25 (разъездной).
Плавучие мастерские № 1-4 (несамоходные).
Плавучий кран ХПК-1.
Плавучая электростанция ХПЭС-1.
Плавучий док (без обозначения).
Землечерпательный снаряд ЗМ-1.
Баржи (несамоходные) ДБ-61 - 65, 68 (все —десантные), ПБ-7 (минная база), ПВ-14 (сухогрузная), № 170 (наливная), № 174 (сухогрузная), № 225 (сухогрузная), без номера (бывшая Х-58400, сухогрузная), трал-баржи.
Земпеотвозная шаланда П-1 (несамоходная). Примечание.
Кроме того, в период боевых действий в августе 1945 года флотилии временно и на различные сроки придавался (без официального включения в ее состав) ряд гражданских судов Верхне-, Средне- и Нижне-Амурских речных пароходств, в частности:
- пассажирские пароходы "Лермонтов", "Молот", "Серп", "Энгельс";
- буксирные пароходы "Казань", "Минск", "Профинтерн", "Свердловск", "Сталинабад", "Тбилиси";
- пароходы (различного назначения) "Батуми", "Донбасс", "Ереван", "Коккина-ки", "Лейтенант Шмидт", "Пахарь", "5 декабря", "Сормово", "Томск", "Ярославль";
- баржи "Архара", "Калуга", "Крестьянка", "Олекма", "Селенга".
